Em 2035, uma catástrofe viral que atingiu o planeta em 1996, obriga os humanos sobreviventes a viver em grutas subterrâneas. Para tentar perceber as origens da tragédia, Cole (Bruce Willis) viaja até ao passado para enfrentar uma organização conhecida por Exército dos 12 Macacos e recolher uma amostra do vírus assassino, com a qual poderá ser descoberto o antídoto. Mas um erro leva-o a 1990 e a um hospício onde se irá cruzar com a bela Kathryn Railly (Madeleine Stowe), uma psiquiatra, e o psicótico Jeffrey Goines (Brad Pitt). Um "thriller" de Terry Gilliam que valeu a Pitt a sua primeira nomeação para um Óscar (melhor actor secundário). PÚBLICO